El museo divide su espacio expositivo en dos grandes áreas:
El área de paleontología que muestra la evolución paleogeográfica del territorio a través de los testimonios de infinidad de seres que vivieron en nuestra zona hace millones de años.
La isla de Tabarca es una isla pequeña que cubre un área de solo 0,3 km2. En realidad es un pequeño archipiélago de 1800m de largo y 400m de ancho. Santa Pola es el punto más cercano en la península a la isla de Tabarca, que es la única isla habitada en la Comunitat Valenciana. Tabarca es un destino único con una historia interesante que nos recuerda lo que inspiró a los artistas y llamó la atención de los piratas. De hecho, para acabar con la piratería, la isla fue fortificada y habitada por residentes de la isla Tabarqah (Tabarka) en Túnez.
El Camino del Sureste a Santiago parte de la ciudad de Alicante y transcurre por las provincias de Alicante, Murcia, Toledo, Madrid y Zamora donde enlaza en Benavente con la Vía de la Plata o en Astorga con el Camino Francés. A la altura de Albacete confluye con el Camino de Levante que viene desde Valencia.
Cerca del parque de ocio, el Museo de la Habanera y el Centro de Interpretación de la Industria Salinera, se encuentra el inicio de la Vía Verde. Pronto veremos las enormes montañas de sal y pasaremos entre las Lagunas de la Mata y Torrevieja, bordeando ésta última, considerada la laguna salada más grande de Europa, con más de 7 km de longitud y 25 de perímetro. Este Parque Natural es uno de los más importantes de la Comunitat Valenciana y el de mayor extensión lagunar después de la Albufera de Valencia.
Sobre una compleja orografía, se construyó durante la dictadura de Primo de Ribera este ferrocarril que significaba un reto para la ingeniería de la época. Las obras de infraestructura fueron finalizadas en 1932 pero la guerra civil supuso su paralización y el tendido de las vías jamás llegó a ejecutarse. Informes en los años 60 desestimaron su continuación y su trazado, hasta que en 1984 la antigua plataforma quedó para otros fines.
Ruta muy corta que recorre el entorno periurbano de la ciudad de Ibi, donde se alternan bancales de almendros, y olivos. La antigua vía abandonada discurre por el amplio valle agrícola que separa la sierra del Menejador (al norte) que forma parte del Parque Natural del Carrascar de la Font Roja, y la sierra del Cuartel al sur.
También conocida como la Vía Verde de las Virtudes, el nombre de Xixarra viene del apelativo que tenían todos los trenes alicantinos por su aspecto exterior y en referencia al monótono ruido de las locomotoras comparadas con el sonido de las cigarras que abundaban a lo largo de todo el trayecto.
Está construida sobre el antiguo ferrocarril Alcoi-Alicante que permitía la exportación de los productos manufacturados de Alcoi. Desde el momento que dejamos la ciudad, el recorrido se acerca al Parque Natural del Carrascar de la Font Roja, disfrutando de la gran diversidad paisajística del entorno, circulando entre pinos, carrascas, arces, fresnos y robles valencianos.
Esta Vía Verde fue inaugurada en un primer momento como un recorrido dentro de la red de Caminos Naturales. Sigue el trazado del antiguo ferrocarril Carcaixent-Dénia que transportaba naranjas hasta los puertos de Gandía y Dénia para su exportación.